Протоиерей Иоанн Смирнов был назначен на служение в храм иконы Божией Матери «Знамение» 30 декабря 1935 года. 20 ноября 1937 года, во время всенощного бдения накануне Михайлова дня, прямо в храме он был арестован и 10 декабря, в день празднования в честь иконы Божией Матери «Знамение», расстрелян на Бутовском полигоне.
Аполинария Тупицына была прихожанкой Знаменской церкви, арестована 17 сентября 1937 года за «антисоветскую деятельность» и расстреляна на Бутовском полигоне 13 октября 1937 года.
В храме празднуются дни их памяти и установлена мемориальная доска с именами новомучеников. 5 апреля 2014 года состоялось освящение новой иконы Знаменских новомучеников — священномученика Иоанна (Смирнова) и мученицы Аполлинарии (Тупицыной). Икону разместили у северной стены храма, рядом с образом Божией Матери «Озерянская».
