Место погребения священномученика Вениамина (Казанского) неизвестно. Владыка Вениамин и пострадавшие вместе с ним архимандрит Сергий (Шеин), И.М. Ковшаров и Ю.П. Новицкий были расстреляны на станции Пороховая Ириновской узкоколейной железной дороги на окраине Петрограда и, предположительно, там же и похоронены.
Еще в советское время верующие установили символический крест в память митрополита Вениамина на Никольском кладбище Александро-Невской Лавры, который и сейчас служит местом поклонения священномученику.
