В 1929 году священник Феодор Богоявленский был назначен настоятелем Михайло-Архангельского храма, 6 октября 1930 года его арестовали по доносу и приговорили к трем годам лагерей. Выйдя из заключения, отец Феодор вновь вернулся в Средний Карачан и продолжил свое служение в том же Михайло-Архангельском храме вплоть до своего второго ареста в 1937 году. Михайло-Архангельскую церковь закрыли, иконы и церковную утварь сожгли. Впоследствии здание церкви использовалось под колхозное зернохранилище.
Ныне храм восстанавливается, южный придел его по благословению Высокопреосвященнейшего Сергия, митрополита Воронежского и Борисоглебского устроен во имя священномученика Феодора Богоявленского.
