В 1926–1935 годах на Ваганьковском кладбище хоронили расстрелянных по приговорам органов ОГПУ-НКВД, а также умерших в московских тюрьмах. Погребения осуществлялись на отдалённых участках кдабища, в основном на западной его стороне, возле оврага, образованного поймой Ваганьковского ручья. Сегодня это площадь участков 43, 56, 58, 59 и 60; все они заняты вторичными захоронениями. Исследования территории кладбища не производились, однако сотрудники кладбища регулярно находят останки расстрелянных, при этом глубина нахождения слоев обычно не превышает 1 метра. Обнаруживая эти страшные находки, сотрудники кладбища аккуратно собирают их и затем закапывают ниже в подошве могилы, а сверху производится новое захоронение.
О фактах погребения на Ваганькове тел казнённых свидетельствуют и документы, имеющиеся в их личных делах в архиве КГБ: требования от коменданта или дежурного того органа, который приводил приговор в исполнение, к директору кладбища принять для захоронения определенное количество тел и расписки об исполнении этих требований.
Список похороненных на Ваганьковском кладбище (733 человека) впервые опубликован Обществом «Мемориал» в 1995 году, впоследствии он был расширен и дополнен. В 1994 году на кладбище при входе установлен памятник «Жертвам политических репрессий. 1927–1937». 40 человек из пострадавших здесь были расстреляны исключительно за свою принадлежность к Православной Церкви, среди них есть причисленные к лику святых.
В День памяти жертв политических репрессий у памятника совершается лития по всем невинно убиенным. В кладбищенском храме Воскресения Словущего находится икона "Новомученики Ваганьковские" и празднуются дни памяти пострадавших здесь святых, в престольный праздник служится лития возле участков 56 и 43 – месте массовых захоронений жертв репрессий.
https://dzen.ru/a/YqNMMpvIwQFpZR8q
https://www.mapofmemory.org/77-03
https://vagankovo.net/news-archiv/30-oktjabrja-2020-goda-den-pamjati-zhertv-sovetskih-repressij