В начале XVII в. на этом месте находился "Убогий дом" (место, куда свозили неопознанных покойников, найденных на улицах, для отпевания и погребения) с деревянной Никольской церковью при нем. Здание неоднократно горело, его восстанавливали на пожертвования прихожан и к 1657 г. перестроили в камне. Позднее подобные заведения стали организовывать только за границами города, и к 1677 году церковь стали именовать по Звонарской слободе. В этот период в храме действовали приделы Николая Чудотворца, Димитрия Ростовского и Усекновения главы Иоанна Предтечи.

В 1762 году по приказу Екатерины II на средства сенатора Ивана Воронцова возвели новую церковь по проекту архитектора Карла Бланка.  Церковь имела небольшой размер и состояла из колокольни, двухпридельной трапезной и храма с апсидой, выстроенных вдоль одной оси. Ряд исследователей полагает, что новое сооружение возвели на фундаменте старого. В 1766 году существовавшие ранее приделы дополнили ещё одним, который освятили в честь Сергия Радонежского. Строительство и отделка были окончены в 1781 году, главный престол новой церкви освятили в честь Успения Пресвятой Богородицы. В начале XIX в. храму пожертвовали икону Божией Матери « Взыскание погибших». Церковь сильно пострадала во время пожара 1812 г. После освобождения Москвы её реконструировали, заменив два крыльца и соорудив новые двухпрестольную трапезную и колокольню.

С февраля 1919 по 13 февраля 1933 года настоятелем храма был прот. Александр Зверев, в будущем священномученик (причислен к лику святых новомучеников Российских постановлением Священного синода Русской православной церкви 6 октября 2001 года для общецерковного почитания).

В 1933 году церковь закрыли, а здание переоборудовали под складские помещения. Часть икон передали в действующий храм Сергия в Пушкарях. По свидетельству современников, перед закрытием церкви Николы в Звонарях одна из прихожанок вынесла икону Божией Матери «Взыскание погибших» и в 1981-м передала её Пюхтицкому монастырю, располагающемуся в Эстонии. В середине 1960-х годов церковь на Рождественке заняла кафедра живописи и рисунка (МАрхИ), который находился в бывшей усадьбе Воронцова.

В 1993 году патриарх Алексий II подписал указ о создании на территории Москвы подворья Пюхтицкого женского монастыря. Для его размещения была выбрана церковь Николая Чудотворца в Звонарях.

Персоналии

протоиерей Александр Александрович Зверев

Предметы

Яйцо пасхальное, из вещей сщмч. Александра Зверева

Полковая книга, 1832 г.

Записка сщмч. Александра Зверева из тюрьмы

Фотография матери сщмч. Александра Зверева

Места памяти

Бутовский полигон

Музей Памяти пострадавших в Бутове