Священномученик Владимир Московский (Амбарцумов) — особый покровитель Зачатьевской обители, с которой он связан узами и духовного, и кровного родства. Священномученик Владимир является дедом по материнской линии настоятельницы монастыря, игумении Иулиании, а значит, и «дедушкой» всех монастырских сестер.
24 ноября 2004 года в Зачатьевском монастыре был освящен придел во имя священномученика Владимира Московского, где с того дня совершаются богослужения в дни памяти особо почитаемых святых новомучеников и исповедников Российских. В 2012 году исполнилось 120 лет со дня рождения и 75 лет со дня мученической кончины священномученика Владимира Амбарцумова. 19 ноября 2013 года по благословению Святейшего Патриарха Кирилла Высокопреосвященнейший архиепископ Сергиево-Посадский Феогност совершил Великое освящение Владимирского придела.